İletişim
Proje görüşmesi başlatın
Formu doldurmanız ilk görüşmenin yarısını halleder: hedefi, beklentiyi ve gizlilik tercihinizi peşinen biliyoruz.
Görüşme hazırlığı
Kapsamı birlikte netleştirelim
Altı soruyu yanıtlayın; hangi çalışmaların gerektiğini, bizden hangi girdileri hazırlamanız gerektiğini ve sonunda hangi dosyaları alacağınızı anında görün.
Bu bir teklif değildir. Fiyat, süre ve aday sayısı kapsam görüşmesinde belirlenir. Araç hiçbir bilimsel sonuç veya başarı tahmini üretmez.
Proje görüşmesi
Hedefinizi kısaca tarif edin
Aşağıdaki alanlar ilk görüşmenin yarısını peşinen halleder. Gizlilik sürecini önce başlatmak isterseniz işaretleyin.
İlk başvuruda gizli diziler, yayımlanmamış yapılar veya hassas proje dosyaları paylaşmayın. Teknik ayrıntılar uygun gizlilik süreci sonrasında alınır.
İletişim altyapısı (alıcı adres, gönderen domaini, bot doğrulama) henüz yapılandırılmadı. Bu yüzden gönder düğmesi devre dışı: başvurunuzun iletildiğini söyleyip kaybetmek istemiyoruz.
Onaylanmış bir alternatif iletişim adresi de henüz yayımlanmadı. Adres uydurmuyoruz; iş sahibi bilgiyi verdiğinde buraya eklenecek.
Bundan sonra ne olur
- Başvuru ekibe e-posta olarak iletilir.
- Gerekirse gizlilik süreci başlatılır; teknik ayrıntıları ondan sonra paylaşırsınız.
- Kapsam görüşmesinde hedef, bölge, aday sayısı ve dahil analizler yazılı hâle gelir.
- Kapsam netleştikten sonra teklif iletilir.
Görüşme öncesi iki önemli nokta
Gizli bilgiyi nasıl paylaşacağız?
İlk başvuruda paylaşmayın. Formda yalnız gizli olmayan kısa bir özet isteriz. Teknik ayrıntılar, diziler ve yayımlanmamış yapılar uygun gizlilik süreci tamamlandıktan sonra alınır. Formda gizlilik sürecini önce başlatmak istediğinizi işaretleyebilirsiniz.
Kapsam ve fiyat nasıl netleşiyor?
Kapsam görüşmesinde hedef, incelenecek bölge, seçicilik gereksinimi, kaç aday üzerinde çalışılacağı ve hangi analizlerin dahil olduğu yazılı hâle getirilir. Fiyat bu kapsama göre teklif olarak iletilir; sabit bir liste fiyatı yayımlamıyoruz.
Bu sayfadaki terimler
Konuya yabancıysanız buradan başlayabilirsiniz. Açıklamalar kısa tutuldu.
- hedef
- Üzerinde çalıştığınız protein — etkilemek, bloke etmek veya tanımak istediğiniz molekül.
- bağlayıcı
- Hedefe yapışacak şekilde tasarlanan protein. Anahtar-kilit ilişkisindeki anahtar gibi düşünebilirsiniz.
- epitop
- Hedef proteinin yüzeyinde, bağlanmanın gerçekleşmesini istediğiniz belirli bölge.
- paralog
- Hedefe benzeyen akraba protein. Tasarımın yanlışlıkla bunlara da bağlanmaması istenir.
- seçicilik
- Tasarımın hedefe bağlanıp benzer proteinlere bağlanmama becerisi.
- UniProt
- Protein dizilerinin ve temel bilgilerinin herkese açık veritabanı.
- PDB
- Deneysel olarak çözülmüş protein yapılarının herkese açık veritabanı.
- hesapsal
- Bilgisayarda yapılan çalışma. Deney değildir; hangi adayın denenmeye değer olduğunu gösterir.
- moleküler dinamik
- Yapının zaman içinde nasıl hareket ettiğini simüle etme. Kompleksin dağılıp dağılmadığını gösterir.
- ΔΔG
- Tek bir harf değişikliğinin (mutasyon) proteini daha kararlı mı yoksa daha oynak mı yaptığının tahmini.
- BLI / SPR
- Laboratuvarda bağlanmayı gerçekten ölçen iki yöntem. Hesapsal tahminin doğrulandığı yer burasıdır.
- agregasyon
- Protein moleküllerinin birbirine yapışıp kümelenmesi — üretimde sık karşılaşılan bir sorun.
- rezidü
- Protein zincirini oluşturan tek bir amino asit. Zincirdeki tek bir halka gibi.
- arayüz
- İki proteinin birbirine değdiği yüzey. Tasarımın iyi olup olmadığı büyük ölçüde burada belli olur.
- docking
- Küçük bir molekülün hedefin cebine nasıl oturabileceğini bilgisayarda deneme.
- kompleks
- Birbirine bağlanmış iki veya daha fazla molekülün oluşturduğu yapı.
- sanal tarama
- Çok sayıda bileşiği bilgisayarda eleyip en umut verici olanları öne çıkarma.